Георг Иоганн Маттарнови родился в середине 1660-х годов в местечке Хайлигенбайль. Его настоящие имя и фамилия - Юрген Маттарн. В начале он обучался ремеслу столяра, а затем скульптора. С 1696 по 1711 год он был скульптором маркграфа Бранденбургского в городе Шведт на Одере. В 1698 году он именовал себя уже на итальянский манер - Георг Маттарнови.
Скульптор исполнял резные работы в павильонах дворцового парка в Шведте, изготовил несколько алтарей и надгробных памятников в храмах Бранденбурга и Восточной Пруссии.
С Андреасом Шлютером Маттарнови познакомился, вероятно, в Берлине, который он посещал сопровождая своего покровителя. Шлютером Маттарнови был приглашён в Санкт-Петербург в качестве помощника. В России он оказался 8 февраля 1714 года.
После смерти немецкого архитектора Маттарнови завершал его проекты. Среди таких работ - строительство в 1715-1719 годах Грота в Летнем саду. Маттарнови же построил в Летнем саду два павильона и галерею-колоннаду (1715-1717 годы), в которой была установлена статуя Венеры.
В 1716-1720 годах по проекту Маттарнови на пересечении Невского проспекта и реки Мойки был построен Мытный двор. В 1717-1722 годах возводилась спроектированная им Исаакиевская церковь. В 1718 году по проекту Маттарнови было заложено здание Кунсткамеры. В 1718-1719 годах архитектор достраивал дом генерал-прокурора сената П. И. Ягужинского на Дворцовой набережной. В 1719-1722 годах Георгом Маттарнови был построен третий Зимний дворец, который стал центром застройки Дворцовой набережной. Составление проекта этого, не сохранившегося Зимнего дворца, приписывают и Андреасу Шлютеру.
Кроме всех этих работ, заботами Маттарнови были строительство типовых домов для служащих Канцелярии городовых дел на Городовом острове (Петроградской стороне), совместное с Доменико Трезини строительство Партикулярной верфи, составление проекта планировки Адмиралтейской стороны. Последнее из этих дел Маттарнови осуществлял будучи назначенным в 1718 году архитектором Прлицмейстерской канцелярии.
Георг Иоганн Маттарнови умер 2 ноября 1719 года, был похоронен на иноверческом кладбище при Сампсониевском соборе. Его могила до сегодняшнего дня не сохранилась. Многие проекты зодчего были продолжены архитектором Н. Ф. Гербелем, к которому перешли и ученики Маттарнови.