Этот участок между рекой Карповкой и Песочной (ныне Профессора Попова) улицей с середины XIX века принадлежал купцу И. Балашову, а затем купцу И. М. Алонкину. В 1850-х годах на Песочной улице был построен деревянный дом с мезонином. В 1891 году участок приобрёл известный в то время литератор и журналист В. О. Михневич (автор путеводителя "Петербург весь на ладони"). Для него архитектором Е. П. Вейнбергом деревянное здание было надстроено вторым этажом. Такой облик дом №10 на улице Профессора Попова имеет по сей день.
В 1899 году после смерти Михневича две трети участка с деревянными строениями были переданы Литературному фонду, который официально назывался "Общество пособия нуждающимся литераторам и учёным". Михневич был членом этого фонда. У Михневича гостями были издатель А. С. Суворин, писатель Н. С. Лесков.
В доме на Песочной улице жили в основном писатели. Квартиры сдавались писателям в наём либо за умеренную плату, либо безвозмездно. В 1912 году в квартире №12 поселились Михаил Васильевич Матюшин (известный художник, музыкант, издатель и педагог) и его жена Елена Генриховна Гуро. Их квартира стала центром петербургского авангарда. У Матюшина и Гуро были гостями К. С. Малевич, В. В. Маяковский, П. Н. Филонов, О. В. Розанова и другие. Литературному фонду дом принадлежал до 1917 года. Е. К. Гуро умерла в 1913 году. С новой женой Ольгой Константиновной Громозовой Матюшин жил здесь и после революции.
Дом №10 продолжал оставаться культурным центром Ленинграда и после смерти Матюшина, в годы Великой Отечественной войны. Здесь бывали А. А. Фадеев, М. А. Дудин. С начала августа 1942 года до ноября 1944 года у Ольги Константиновны жили писатель Всеволод Вишневский и его жена художница С. К. Вишневская.
Во время блокады практически все деревянные дома в городе были разобраны на дрова. Такая же судьба по всей видимости ждала и дом Матюшина. По инициативе Вишневского писатели обратились в горком Ленинграда с просьбой сохранить дом. Эта просьба была удовлетворена. О. К. Матюшина жила здесь до своей смерти в 1974 году.
6 июня 1977 года решением исполкома Ленинградского городского Совета народных депутатов здание было передано Государственному музею истории Ленинграда. В июле 1979 года дом был расселён, после чего и состоялась эта передача. С 1987 года велась реконструкция дома. В 1990 году восстановленный сруб сгорел, который построили заново в 1993-1995 годах. Дальнейшие работы из-за отсутствия финансирования были продолжены только в 1999 году. В апреле 2004 года было принято решение об открытии в доме Матюшина Музея петербургского авангарда. Именно этот музей, филиал Музея истории Санкт-Петербурга, открыт с декабря 2006 года в доме №10 на улице Профессора Попова.
