Церковь Покрова Пресвятой Богородицы находится на Боровой улице, которая в конце XIX века являлась фабричной окраиной Петербурга. Она построена для епархиального братства во имя пресвятой Богородицы, целью которого было обращение людей в православную веру, на пожертвования рабочих и фабрикантов в 1889-1897 годах. Автором проекта храма стал архитектор Николай Никитич Никонов. Он же возвёл соседний Братский дом.
Церковный комплекс Братского храма и дома созданы в русским стиле с ориентацией на декоративные мотивы московского и ярославского зодчества XVII века. Храм был увенчал пятью куполами и шатровой колокольней. Украшавшую фасад и интерьеры майолику выполнили на фабрике Кузнецова. Внутренней отделкой занимались суздальские мастера.
С 1901 года Покровская церковь стала приходской. В 1917 году её настоятелем и Председателем Братства стал Митрополит Петроградский и Гдовский Венимамин. Через пять лет он был арестован и расстрелян, а в 1992 году РПЦ причислила его к лику святых.
Церковь Покрова Пресвятой Богородицы была закрыта в 1933 году. Здание использовалось разными организациями. В годы войны оно серьёзно пострадало. Ещё больший урон бывшей церкви нанесло использование её в качестве производственного цеха НПО "Ленбуммаш". Храм утратил колокольню, существенные детали конструкции, все купола. Внутреннее помещение было полностью перепланировано.
В 1989 году полуаварийное здание было передано евангельским христианам-баптистам. С 1992 года проводится его реставрация, в церкви открыт "Дом Евангелия".