Дом №6 на набережной Макарова стоит на месте, которое с начала XVIII века занимал Гостиный двор. Это торговое заведение находилось здесь благодаря работающему на берегу Малой Невы торгового порта, занимало целый квартал между Тифлисской улицей и Биржевой линией. В 1820-х годах Старый Гостиный двор реконструировался по проекту архитектора К. Росси.
Во второй половине XIX века торговый порт был переведён на Гутуевский остров. Старый Гостиный двор перестал выполнять свои первоначальные функции. Руководство города приняло решение о его сносе. Восточную часть старого сооружения начали разбирать осенью 1899 года. В 1900-1901 годах здесь было построено трёхэтажное здание Главного управления неокладных сборов и казённой продажи питей. Его проект составил гражданский инженер К. К. Тарасов.
После революции в 1918 году здание занял Совет народного хозяйства Северной области (Совнархоз). В 1925 году ряд помещений занял Физиологический институт, позже реорганизованный в Институт физиологии имени И. П. Павлова. На фасаде укреплены памятные доски с именами работавших здесь академиков И. П. Павлова, Л. А. Орбели, К. М. Быкова, В. Н. Черниговского, А. М. Уголева. С 1925 по 1927 год в доме №6 работали Пушкинский дом и Толстовский музей. Пушкинский дом отсюда переехал в соседнее здание Таможни.
В 1920-х годах часть здания Главного управления неокладных сборов заняла Постоянная комиссия по изучению естественных производительных сил СССР (КЕПС), которой руководил В. И. Вернадский. При комиссии работало несколько отделов, один из которых позже вырос в крупный академический институт. Так в 1920-1930-х годах здесь располагалась лаборатория генетики, которой впоследствии руководил Н. И. Вавилов.
Сейчас дом №6 продолжает занимать Институт физиологии. С ним соседствует факультет психологии Петербургского университета.
